一、市卫生健康局设下列内设机构：
1、办公室 (党建股)、
2、人事股
3、规划财务与信息股
4、疾病预防控制股 (卫生应急办公室)
5、医政药政与体制改革股 (市国防动员委员会医疗卫生
办公室)。
6、中医药管理与产业发展股。
7、基层卫生与妇幼健康服务股。
8、人口监测与家庭发展股
9、政策法规与综合监督股
10、健康硒都办公室
二、市卫生健康局所属二级单位:
1、恩施市中心医院
2、恩施市疾病预防控制中心
3、恩施市妇幼保健计划生育服务中心
4、恩施市卫生和计划生育综合监督执法局
5、会计核算中心
6、流动人口计划生育管理站
7、计划生育协会
8、爱卫办
